EpiSightTM Bisulfite Conversion Kit Ver.2
DNA 重亚硫酸盐转化试剂盒
Enhanced Bisulfite Reaction 抑制因亚硫酸氢钠反应的 DNA 分解,扩增长链长度。
通过添加专利产品 Bisulfite 溶液和反应促进剂(Enhancer),能抑制模板 DNA 的分解,能让胞嘧啶转化为尿嘧啶的效率大幅度上升。使用离心柱能使 DNA 纯化操作更加简便。
结合专用的 Taq DNA Polymerase,即使是亚硫酸氢钠反应后,PCR 扩增比较困难的碱基序列也能稳定且高效地扩增。
◆特点
● 离心柱操作简单
● 专利的 Enhancer 抑制 DNA 分解
● 有效扩增富含 CpG 的序列
● 热启动聚合酶防止非特异性扩增
有以下需求的可以考虑使用本产品
● 扩增长链进行高效分析
● 非甲基化胞嘧啶不转换为尿嘧啶的情况
● 甲基化胞嘧啶转换为尿嘧啶的情况
● 想提高 PCR 扩增效率
◆试剂盒内容(kit 内容)
EpiSightTM Bisulfite Conversion Kit Ver.2(20次)
Bisulfite solution
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11.8 mL×1
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Enhancer
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100 µL×1
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吸附缓冲液
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10 mL×1
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洗涤液
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4.8 mL×1
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Desulfonation buffer(脱磺缓冲液)
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1 mL×1
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洗脱缓冲液
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500 µL×1
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离心柱
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20个
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EpiSightTMBisulTaqTM DNA Polymerase,recombinant,Solution Ver.2(20次)
BisulTaqTM DNA Polymerase,recombinant,Solution Ver.2
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10 µL×1
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10×反应缓冲液
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100 µL×1
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dNTPs溶液(各 2 mmol/L)
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100 µL×1
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◆使用例1
以小鼠 ES 细胞(胚胎干细胞)和 M1细胞(白血病衍生细胞)的基因组 DNA 为模板,经过亚硫酸盐处理后,PCR 扩增干细胞未分化标记FGF4启动子区。PCR 扩增的链长是 521bp,CpG 二核苷酸数为 61 位,对于亚硫酸氢钠 PCR 扩增链较长,因为 GC 含量高,被认为是对三维结构影响较大的区域。
ES 细胞有干细胞未分化标记 FGF4 的 mRNA 表达,启动子区为非甲基化状态;M1 细胞没有用于体细胞分化的 Fgf4 的 mRNA 表达,被认为启动子区处于甲基化状态。
● 样本:小鼠 ES 细胞和小鼠 M1 细胞的基因组 DNA、
● PCR 扩增链长:521bp(小鼠 Fgf4 启动子区)
● CpG:61 位
● PCR 扩增区域 GenBank Accession No.
● AC_149593 : 230224–230744
结果
ES 细胞和 M1细胞的 PCR 扩增产物在克隆后,得到分析 11 个样本的碱基序列。小鼠 ES 细胞的 Fgf4 启动子区为非甲基化状态。小鼠 M1细胞的 Fgf4 启动子区为甲基化状态。
◆使用例2
以 Lambda DNA 为模板,通过使用该试剂盒和 DNA 聚合酶在 Bisulfite 反应后,扩增 910bp 目的区域,分析碱基序列。Lambda DNA 中所有的胞嘧啶都是非甲基化,Bisulfite 反应后全部被转化为尿嘧啶,预测 PCR 扩增产物中不存在胞嘧啶。
● 样本:Lambda DNA
● 非甲基化胞嘧啶:150个
● PCR 扩增链长:910pb
● PCR 扩增区域 GenBank Accession No NC_001416 : 26062–269
结果
下图所示,不存在胞嘧啶,150 处的胞嘧啶全部转化为胸腺嘧啶。
以往的 Bisulfite 法中,DNA 分解严重,条件设置困难,本产品能简单地成功实现 900 bp 以上的 PCR 产物扩增。