试剂怎么用——组织化透明试剂


试剂怎么用——组织化透明试剂

试剂怎么用——组织化透明试剂




试剂怎么用——组织化透明试剂

即使是为同一目的所用的试剂种类繁多,同一物质也会有不同的浓度、纯度、规格。

因此,经常有研究人员向我们问到“不知道哪一种适合自己的实验”等。

为了解决这样的问题,小光老师将介绍一些正确区分使用FUJIFILM Wako品牌试剂的方法。

◆组织透明化试剂


FUJIFILM Wako能够提供Scale法、CUBIC法、SeeDB2法、CLARITY法等各种用于透明化的试剂,客户可根据实验目的来选择合适的组织透明化方法。

CUBIC法简便且重现性高,适合全脑成像。CLARITY法可有效应对样本脆弱性和透明度不足的问题。这两种方法因其样品会发生膨润且微结构并不一定能够保持,所以相比微结构更适合细胞水平轴突束水平的成像。

SeeDB2法不会引起样本膨胀或收缩,因此适用于定量分析各轴突树突(0.5-数μm),或观察树突棘以及更精细的结构(0.2-1 μm)。然而,若深度超过3-4 mm,则难以观察到单一的轴突。

Scale法在透明度和组织结构保持能力方面居于CUBIC法和SeeDB2法之间。因此,适用于无需使用SeeDB2法进行微结构观察时或进行透明化测试时等情况。此外,使用Scale法也可轻松实现类器官和球状体透明化。

产品名称

ScaIe(ScaleS)

CUBIC

SeeDB2

CLARITY

观察对象

全脑
类器官·球状体

全脑
大脑以外的组织:骨骼

脑切片
类器官·球状体

全脑
大脑以外的组织:骨骼

结构保持能力

暂时性膨润

非常高(不伸缩)

暂时性膨润

可使用的染料

荧光蛋白
荧光染料

荧光蛋白
荧光染料

荧光蛋白
荧光染料(小心褪色)

荧光蛋白
荧光染料

操作复杂性

非常简便

非常简便

简便

复杂

操作时间
(2 mm厚脑切片)

约1天

约5天

约3天

约1周

产品编号

299-79901

290-80801

294-80701

223-02112

(VA-044)

631-26271

脂质除去用电泳槽)

试剂怎么用——蛋白定量


试剂怎么用——蛋白定量

试剂怎么用——蛋白定量




试剂怎么用——蛋白定量

即使是为同一目的所用的试剂种类繁多,同一物质也会有不同的浓度、纯度、规格。

因此,经常有研究人员向我们问到“不知道哪一种适合自己的实验”等。

为了解决这样的问题,小光老师将介绍一些正确区分使用FUJIFILM Wako品牌试剂的方法。

◆蛋白定量试剂


在Western blotting或ELISA中,比较样品之间的蛋白表达水平时,需要评估总蛋白量。蛋白的定量方法有许多种,但需要从检测灵敏度、检测时间以及在表面活性剂和还原剂等条件下是否可检测等角度来选择合适的定量试剂和方法。


● Bradford法(Bradford assay)

CBB G-250能与蛋白质的碱性氨基酸残基、N末端氨基酸以及芳香族氨基酸形成非共价键,最大吸收波长由465 nm变为595 nm。可通过测定595 nm处的吸光度变化来定量蛋白。


● Lowry法(Lowry protein assay)

在碱性条件下,向蛋白溶液中加入双缩脲(Biuret )试剂后,双缩脲试剂中存在的Cu(II)与蛋白形成络合物。随后添加Folin-Ciocalteu试剂,通过色氨酸、酪氨酸和半胱氨酸,使磷钨酸和磷钼酸被还原,蛋白溶液呈现蓝色。可通过测定750 nm处的吸光度来定量蛋白。


● BCA法(Bicinchoninic acid assay)

Lowry法的改良方法。在碱性条件下,Cu(II)与蛋白形成络合物,色氨酸、酪氨酸、半胱氨酸将Cu(II)还原为Cu(I)。向Cu(I)中添加二辛可宁酸(Bicinchoninic Acid),形成在562 nm处呈现出强波长吸收性的深紫色络合物。通过测定此时的吸光度来定量蛋白。


● 邻苯三酚红·钼络合物法(Pyrogallol red-molybdenum assay)

邻苯三酚红和钼(VI)结合,形成最大吸收波长为470 nm的络合物。在酸性条件下,络合物与蛋白的结合使其最大吸收波长变成约600 nm1)。可通过测定600 nm处的吸光度来定量蛋白。

方法

优点

缺点

Bradford法

操作简单。
不易受还原剂和螯合剂的抑制。

受表面活性剂的抑制。

Lowry法

检测灵敏度高。

检测花费的时间长。
受还原剂(硫醇等)的抑制。

BCA法

相对灵敏度高,线性范围广。
不易受表面活性剂和变性剂的抑制。

受螯合剂和还原剂的抑制。

邻苯三酚红·钼络合物法

有效定量尿液和脑脊液中的蛋白

对小分子蛋白的反应性低。

【参考文献】


1)渡辺信⼦,⻲井幸⼦,⼤久保昭⾏,⼭中學: 臨床検査, 30(7), 778(1986).

2)鈴⽊祥夫: ぶんせき,1,1(2018).

◆产品列表

产品编号

产品名称

 包装

Bradford法

168-25911

Protein Assay Bradford Reagent

1 L

BCA法

297-73101

Protein Assay BCA Kit

250 tests

邻苯三酚红·钼络合物法

295-78401

Protein Assay Rapid Kit wako II

100次

试剂怎么用——WB用膜


试剂怎么用——WB用膜

试剂怎么用——WB用膜




试剂怎么用——WB用膜

即使是为同一目的所用的试剂种类繁多,同一物质也会有不同的浓度、纯度、规格。

因此,经常有研究人员向我们问到“不知道哪一种适合自己的实验”等。

为了解决这样的问题,小光老师将介绍一些正确区分使用FUJIFILM Wako品牌试剂的方法。

◆WB用膜


● 硝酸纤维素膜

硝酸纤维素膜是由纤维素羟基经硝酸酯化而形成的,主要通过疏水相互作用进行蛋白的非特异性吸附。因其易于处理并且可以长期储存的特点,一直被作为印迹膜使用。它具有亲水性,因此无需用甲醇进行预处理。但强度较弱,蛋白的结合能力为~100 μg/cm2,比其他膜小,转录时间过长可能会使已转录的蛋白再次游离。


● 尼龙膜

尼龙膜使用了经尼龙或胺化学改性的尼龙。比硝酸纤维素膜具有更好的蛋白结合能力,尤其是经化学改性的尼龙膜带有正电荷,与带负电荷的蛋白发生强烈的静电相互作用。但由于容易发生蛋白以外的非特异性吸附,必须进行充分的封闭处理。


● PVDF膜

PVDF膜是以聚偏二氟乙烯(PVDF) 为支撑的膜,可通过疏水相互作用吸附蛋白。虽然预处理时需要使用甲醇,但其具有较大的蛋白结合能力、优异的强度和化学相容性,因此经常被用作印迹膜。


膜种类及性质

产品名称
产品编号

蛋白结合能力

优点

缺点

硝酸纤维素膜

ClearTrans® Nitrocellulose Membrane, 0.45μm
037-25653

~100 μg/cm2

操作简单。便宜。

蛋白结合容量小。
    强度低。

尼龙膜

ClearTransR Nylon Membrane, 0.45μm
039-22673

~210 μg/cm2
改性尼龙约为500 μg/cm2

蛋白结合容量大。

容易发生目标蛋白以外的非特异性吸附。
无法进行染色。

PVDF膜

ClearTrans® SP PVDF Membrane, Hydrophobic, 0.2μm
033-22453

300~400 μg/cm2

蛋白结合容量大。
强度高。

需要甲醇处理。

【要点】 膜孔径


用于Western blotting的膜孔径有0.45 μm和0.2 μm。通常使用的是0.45 μm,但转录15 kDa或更小分子量的蛋白质时,0.2 μm具有更高的结合效率并且可以抑制吸附后的游离。

◆参考文献


1)口野嘉幸,平井久丸,櫻林郁之介 編:「遺伝子・タンパク質 実験操作 ブロッティング法」(ソフトサイエンス社)(1987).

2)大藤道衛 編:「電気泳動なるほどQ&A」(羊土社)(2005).

3)森山達哉 編:「バイオ実験で失敗しない! 検出と定量のコツ」(羊土社)(2005).

试剂怎么用——琼脂糖


试剂怎么用——琼脂糖

试剂怎么用——琼脂糖

试剂怎么用——琼脂糖

即使是为同一目的所用的试剂种类繁多,同一物质也会有不同的浓度、纯度、规格。

因此,经常有研究人员向我们问到“不知道哪一种适合自己的实验”等。

为了解决这样的问题,小光老师将介绍一些正确区分使用FUJIFILM Wako品牌试剂的方法。

◆琼脂糖

应用于核酸电泳的琼脂糖是从石花菜、江蓠等红藻中所提取的高纯度琼脂。

琼脂糖虽在分子生物学实验中较为常见,但其实种类繁多。为选择适合实验目的的琼脂糖,需检查以下项目。


● 凝胶强度

琼脂糖凝胶破裂所需的载荷用(g/cm2)来表示。标准琼脂糖约为≧1,200 g/cm2(浓度1.5%,Nippon Gene Agarose S)。分离高分子核酸时,需要使用低浓度琼脂糖,因此使用高凝胶强度的琼脂糖可更有效地制备凝胶。反之,在分离低分子核酸时,则使用凝胶强度低的琼脂糖。


● 熔点

琼脂糖凝胶融化的温度。标准琼脂糖的熔点在90°C左右,可通过引入羟乙基来降低熔点。这种低熔点型琼脂糖比双链DNA的变性温度要低,加热至65°C左右即会熔化,因此应用于DNA回收等。低熔点琼脂糖的胶凝化温度也比其他琼脂糖低。


● 硫酸含量

应用于电泳的琼脂糖由琼脂糖和琼脂胶组成,杂质琼脂胶中含有硫酸基团。因此,琼脂糖标准品中的硫酸含量表示琼脂糖的纯化程度,高纯度琼脂糖的硫酸含量表示为≤0.1-0.2%。


● 电渗度

琼脂糖因带有硫酸基等而带负电,接触的缓冲液带正电,两者极性相反。在这种状态下进行电泳时,带正电的缓冲溶液向阴极移动。这种现象称为电渗,也是琼脂糖凝胶电泳中迁移缓慢的原因。因此,一般使用电渗度低的琼脂糖进行电泳。

Nippon Gene Agarose 产品系列及正确使用方法

产品名

产品编号

凝胶强度

熔点

胶凝温度

硫酸含量

电渗度

分离范围

使用浓度范围

用途

Agarose S

318-01195

≧1,200g/cm2

(1.5%)

≦90℃(1.5%)

37-39℃(1.5%)

≦0.1%

≦0.1

0.5-30kbp

0.5-2%

标准琼脂糖。可制备的凝胶浓度范围广,成本低。

Agarose HS

312-01431

≧1,600g/cm2

(1.5%)

≦93℃(1.5%)

37-39℃(1.5%)

≦0.1%

≦0.1

0.5-30kbp

0.5-2%

凝胶强度高,Southern印迹的理想选择。

Agarose H

312-01431

≧2,600g/cm2

(1.5%)

Boil(1.5%)

37-39℃(1.5%)

≦0.2%

≦0.2

1-200kbp

0.2-1%

可制备高凝胶强度、低浓度的凝胶。分离高分子量核酸的理想选择。

Agarose XP

316-06515

≧450g/cm2

(1.5%)

≦65℃(1.5%)

≦30℃(1.5%)

≦0.1%

≦0.1

0.01-20kbp

1-4%

低熔点琼脂糖。凝胶温度低,容易回收核酸。

Agarose 21

319-03244

≧800g/cm2

(3%)

≦85℃(3%)

34-38℃(3%)

≦0.1%

≦0.1

0.01-1.0kbp

2-5%

溶解性优异,可制备高浓度凝胶。分离小分子核酸的理想选择。

Agarose X

313-02681

≧1,200g/cm2

(4%)

≦92℃(4%)

31-39℃(4%)

≦0.15%

0.06-0.14

0.01-1.0kbp

2-6%

溶解性优异,可制备高浓度凝胶。凝胶强度高于Agarose   21。

【参考文献】


1)電気泳動学会 編:「新版 電気泳動実験法」(文光堂)(1989).

2)大藤道衛 編:「電気泳動なるほどQ&A」(羊土社)(2007).

3)Green, R. M. and Sambrook, J.: ”Molecular Cloning A Laboratory Manual, 4th ed.”, Cold Spring Harbor Laboratory Press(2012).

试剂怎么用——核酸染色试剂


试剂怎么用——核酸染色试剂

试剂怎么用——核酸染色试剂

试剂怎么用——核酸染色试剂

即使是为同一目的所用的试剂种类繁多,同一物质也会有不同的浓度、纯度、规格。

因此,经常有研究人员向我们问到“不知道哪一种适合自己的实验”等。

为了解决这样的问题,小光老师将介绍一些正确区分使用FUJIFILM Wako品牌试剂的方法。

◆核酸染色试剂


核酸染色试剂是用于可视化凝胶中的核酸、分析电泳分离后核酸的试剂。溴化乙锭是一种广泛用于核酸染色的染色试剂。但是,溴化乙锭被指出具有致突变性,应谨慎使用。最近,研究人员也开发了安全性高的新型核酸染色试剂。FUJIFILM Wako可提供溴化乙锭,以及及安全性高的SAFELOOK™系列等核酸染色类产品。

◆核酸染色试剂原理


用作核酸染色试剂的化合物,具有通过与核酸结合增强荧光强度的特性。常用的溴化乙锭 (Ethidium Bromide/EtBr) 通过插入DNA双链(也可与单链核酸结合),可将荧光强度提高约20倍。因此能够特异性检测核酸。

试剂怎么用——核酸染色试剂

图1. EtBr结构图

核酸染色试剂常用的化合物除溴化乙锭之外、还有4',6-二脒基-2-苯基吲哚(4',6-diamidino-2-phenylindole/DAPI)、碘化丙啶(Propidium Iodide/PI)和吖啶橙(Acridine Orange/AO)等。

致突变性

由于核酸染色试剂具有与核酸结合的特性,因此可能会诱导突变。实际上,在进行Ames测试时就发现了溴化乙锭具有致突变性1),处理时需谨慎小心。

FUJIFILM Wako提供的SAFELOOK™系列产品,已在Ames测试中确认致突变性低,可放心使用。

 

1) Huang, Qing, and Wei-Ling Fu. "Comparative analysis of the DNA staining efficiencies of different fluorescent dyes in preparative agarose 

1) gel electrophoresis." Clinical Chemistry and Laboratory Medicine (CCLM) 43.8 (2005): 841-842.

选择染色方法

琼脂糖电泳中的核酸染色有预染色、后染色和上样添加染色三种方法。每种方法的优缺点总结如下。


■ 核酸染色试剂的特点

染色方法

预染色

后染色

上样染色

方法

  预先添加染色试剂至琼脂糖凝胶

  电泳后将琼脂糖凝胶浸入到加入染色试剂

  的缓冲液中

  向进行电泳的样品添加染色试剂

优点

  ● 电泳后无需染色时间

  ● 电泳中可观察条带

  ● 即使存在DNA 浓度差,也不会扰乱

  ● 电泳图

  ● 可长时间电泳

  ● 含变性剂的凝胶也可进行染色

● (需更换缓冲液)

  ● 电泳后无需染色时间

  ● 电泳中可观察条带

缺点

  ● 染色试剂结合导致的DNA浓度差,即

  ● 使分子量相同也会使条带在泳道间移动

  ● 使用EtBr时,长时间电泳会导致染色

●   剂流出凝胶

  ● 电泳后需染色时间

  ● 电泳途中不可观察条带

  ● 需均匀加入染色试剂

用户推荐

  想要快速简便获取结果的用户

  想要知道正确结果的用户

  想要快速简便获取结果的用户

产品推荐

  SAFELOOK™绿色核酸染料/ SAFELOOK™红色核酸染

  溴化乙锭

  SAFELOOK™绿色上样染料 (6×)
  SAFELOOK™红色上样染料 (6×)


◆产品列表

低致突变性核酸染料SAFELOOK™


产品编号

产品名称

包装

194-18843

SAFELOOK™ Green Nucleic Acid Stain

SAFELOOK™ 绿色核酸染料

500 μL

197-18833

SAFELOOK™ Red Nucleic Acid Stain

SAFELOOK™ 红色核酸染料

500 μL

199-18153

SAFELOOK™ Load-Green (6×)

SAFELOOK™ 绿色上样染料 (6×)

1 mL

196-18163

SAFELOOK™ Load-Red (6×)

SAFELOOK™ 红色上样染料 (6×)

1 mL

194-18164

1 mL ×5

溴化乙锭

产品编号

产品名称

包装

315-90051

Ethidium Bromide Solution

溴化乙啶溶液(EB溶液)

10 mL

◆参考文献


大藤道衛 編, 電気泳動なるほどQ&A, 羊土社, 2007

田村隆明 編, ライフサイエンス 試薬活用ハンドブック, 羊土社, 2009


※ 本页面产品仅供研究用,研究以外不可使用。

试剂怎么用——蛋白酶抑制剂


试剂怎么用——蛋白酶抑制剂

试剂怎么用——蛋白酶抑制剂

试剂怎么用——蛋白酶抑制剂

即使是为同一目的所用的试剂种类繁多,同一物质也会有不同的浓度、纯度、规格。

因此,经常有研究人员向我们问到“不知道哪一种适合自己的实验”等。

为了解决这样的问题,小光老师将介绍一些正确区分使用FUJIFILM Wako品牌试剂的方法。

◆蛋白酶抑制剂

在蛋白质实验中,蛋白质的分解是不可忽视的一点。蛋白质分解的主要原因是蛋白酶,特别需要注意的是组织和细胞来源的蛋白酶。为了阻止蛋白质被分解,可向提取缓冲液等中添加蛋白酶抑制剂。由于蛋白酶的种类不同,其抑制活性也有所差异,因此通常会将多种蛋白酶混合进行使用。

抑制剂

抑制的蛋白酶

用途

通用

动物细胞用

霉菌/酵母用

2D电泳用

His tag纯化用

AEBSF盐酸盐

丝氨酸蛋白酶

抑肽酶

丝氨酸蛋白酶

E-64

半胱氨酸蛋白酶

EDTA・2Na

金属蛋白酶

亮肽素半硫酸盐

丝氨酸蛋白酶

胰蛋白酶样蛋白酶

贝他汀

氨肽酶B

亮氨酸氨肽酶

胃酶抑素A

天冬氨酸蛋白酶

1,10-菲罗啉一水合物

金属蛋白酶

磷酰胺二钠

金属蛋白酶

类嗜热菌蛋白酶

产品编号

165-26021
161-26023

163-26061
169-26063
162-28231
168-28233

164-28671
160-28673

162-26031
168-26033

167-26101
163-26103

◆相关产品

蛋白酶抑制剂混合物系列