试剂怎么用——核酸染色试剂
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即使是为同一目的所用的试剂种类繁多,同一物质也会有不同的浓度、纯度、规格。
因此,经常有研究人员向我们问到“不知道哪一种适合自己的实验”等。
为了解决这样的问题,小光老师将介绍一些正确区分使用FUJIFILM Wako品牌试剂的方法。
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◆核酸染色试剂
核酸染色试剂是用于可视化凝胶中的核酸、分析电泳分离后核酸的试剂。溴化乙锭是一种广泛用于核酸染色的染色试剂。但是,溴化乙锭被指出具有致突变性,应谨慎使用。最近,研究人员也开发了安全性高的新型核酸染色试剂。FUJIFILM Wako可提供溴化乙锭,以及及安全性高的SAFELOOK™系列等核酸染色类产品。
◆核酸染色试剂原理
用作核酸染色试剂的化合物,具有通过与核酸结合增强荧光强度的特性。常用的溴化乙锭 (Ethidium Bromide/EtBr) 通过插入DNA双链(也可与单链核酸结合),可将荧光强度提高约20倍。因此能够特异性检测核酸。
图1. EtBr结构图
核酸染色试剂常用的化合物除溴化乙锭之外、还有4',6-二脒基-2-苯基吲哚(4',6-diamidino-2-phenylindole/DAPI)、碘化丙啶(Propidium Iodide/PI)和吖啶橙(Acridine Orange/AO)等。
◆致突变性
由于核酸染色试剂具有与核酸结合的特性,因此可能会诱导突变。实际上,在进行Ames测试时就发现了溴化乙锭具有致突变性1),处理时需谨慎小心。
FUJIFILM Wako提供的SAFELOOK™系列产品,已在Ames测试中确认致突变性低,可放心使用。
1) Huang, Qing, and Wei-Ling Fu. "Comparative analysis of the DNA staining efficiencies of different fluorescent dyes in preparative agarose
1) gel electrophoresis." Clinical Chemistry and Laboratory Medicine (CCLM) 43.8 (2005): 841-842.
◆选择染色方法
琼脂糖电泳中的核酸染色有预染色、后染色和上样添加染色三种方法。每种方法的优缺点总结如下。
■ 核酸染色试剂的特点
染色方法
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预染色
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后染色
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上样染色
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方法
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预先添加染色试剂至琼脂糖凝胶
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电泳后将琼脂糖凝胶浸入到加入染色试剂
的缓冲液中
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向进行电泳的样品添加染色试剂
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优点
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● 电泳后无需染色时间
● 电泳中可观察条带
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● 即使存在DNA 浓度差,也不会扰乱
● 电泳图
● 可长时间电泳
● 含变性剂的凝胶也可进行染色
● (需更换缓冲液)
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● 电泳后无需染色时间
● 电泳中可观察条带
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缺点
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● 染色试剂结合导致的DNA浓度差,即
● 使分子量相同也会使条带在泳道间移动
● 使用EtBr时,长时间电泳会导致染色
● 试剂流出凝胶
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● 电泳后需染色时间
● 电泳途中不可观察条带
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● 需均匀加入染色试剂
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用户推荐
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想要快速简便获取结果的用户
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想要知道正确结果的用户
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想要快速简便获取结果的用户
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产品推荐
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SAFELOOK™绿色核酸染料/ SAFELOOK™红色核酸染料
溴化乙锭
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SAFELOOK™绿色上样染料 (6×) SAFELOOK™红色上样染料 (6×)
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◆产品列表
低致突变性核酸染料SAFELOOK™
产品编号
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产品名称
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包装
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194-18843
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SAFELOOK™ Green Nucleic Acid Stain
SAFELOOK™ 绿色核酸染料
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500 μL
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197-18833
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SAFELOOK™ Red Nucleic Acid Stain
SAFELOOK™ 红色核酸染料
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500 μL
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199-18153
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SAFELOOK™ Load-Green (6×)
SAFELOOK™ 绿色上样染料 (6×)
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1 mL
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196-18163
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SAFELOOK™ Load-Red (6×)
SAFELOOK™ 红色上样染料 (6×)
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1 mL
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194-18164
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1 mL ×5
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溴化乙锭
产品编号
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产品名称
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包装
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315-90051
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Ethidium Bromide Solution
溴化乙啶溶液(EB溶液)
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10 mL
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◆参考文献
大藤道衛 編, 電気泳動なるほどQ&A, 羊土社, 2007
田村隆明 編, ライフサイエンス 試薬活用ハンドブック, 羊土社, 2009
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