什么是外泌体


什么是外泌体

金泽大学医学系免疫学 教授

華山 力成

 

什么是外泌体

  近年来,细胞外囊泡(EV)相关的研究正加速发展。2011年每年有约200篇相关论文发布,但2016年一年间有1000篇以上的相关论文发布,论文内容涉及各种生理功能和病理症状等方面。EV大致可分为核内体来源的外泌体和细胞质膜来源的微囊泡,但即便是用提取纯度最高的超速离心法也难以将二者完全分离,所以简单地将10,000×g离心后上清中的EV称为小EV(主要是外泌体)1)。外泌体是由各种细胞分泌的小型膜囊泡(直径30~100nm),存在于大多数体液(如血液、尿液、髓液等)和细胞培养液中。外泌体是由脂质双层膜包被的膜囊泡,产生于称为多囊泡体的细胞外囊泡中,多囊泡体通过与细胞膜融合将外泌体释放到细胞外。外泌体含核内体来源的蛋白质(如ESCRTs)、细胞内运输相关蛋白(如RabGTPase等)及细胞膜来源蛋白(如CD63, CD81等)等各种内分泌细胞来源的蛋白和RNA,同时还含有分泌细胞膜来源和内体膜来源的脂质(如胆固醇和鞘磷脂等)2)。多年来,外泌体被认为参与无用的细胞内含物质的释放。但是近年来,外泌体在活体内作为运载脂质、蛋白质、RNA等细胞间信息传递的新型媒介而倍受瞩目。随着其功能在生理及病理功能的阐明,外泌体在临床应用的相关研究中,特别是诊断治疗、生物标记的开发也迅速发展起来。

  现在,外泌体研究几乎涉及所有的研究领域(免疫、神经系统、癌症、内分泌、循环系统等)。例如,免疫细胞来源的外泌体含有抗原肽/MHC复合体和可能控制着免疫细胞间抗原信息的交换、免疫细胞活化/非活化等各种免疫应答机制的各种抗原3)。外泌体在神经系统中与神经回路的控制相关4),同时各种神经退行性疾病的致病蛋白还可以通过外泌体释放到细胞外并传递到其他细胞,与病情发展密切相关5)。 癌细胞释放的外泌体含有许多与血管新生和免疫逃逸相关的分子,构建适合癌细胞生长的微环境,促进癌细胞的发展6)。另外,癌细胞来源的外泌体上粘着分子的表达形式决定着癌症向器官的转移途径7)。最近,有报告指出脂肪细胞释放的外泌体对肝脏的遗传基因表达有控制作用8)。许多病毒利用外泌体的产生路径感染细胞,受病毒感染的细菌和寄生虫通过外泌体控制其他受细胞感染的细菌、寄生虫的活动9、10)

  上述这些功能几乎都是通过细胞分泌到外泌体中的分子引起的。其中已发现外泌体内含有分泌细胞来源mRNA和miRNA,外泌体与细胞间遗传基因表达信息的水平传播相关性倍受瞩目11)。这些RNA被外泌体的脂质双层膜所保护,不会被核糖核酸酶所分解,可以在血液和体液中稳定存在。被靶细胞吞噬的外泌体通过与内体膜融合,将RNA释放到靶细胞的细胞质中。释放出来的mRNA翻译为蛋白质,但miRNA抑制目的基因的翻译,因此外泌体在靶细胞内控制基因的表达。外泌体的蛋白质有数万种,mRNA、miRNA的种类有数千种以上,它们的结构除了受细胞来源不同的影响,还受到细胞状态不同的影响。另外,外泌体中这些物质的结构与它们在分泌细胞内的结构不同,所以可能存在一种外泌体特异蛋白和mRNA/miRNA在外泌体内选择性积累的机制。这种特异性可将外泌体内的RNA作为生物标记,更进一步作为治疗开发方法的靶点。外泌体中的mRNA一旦被靶细胞吞噬,能够引起这个细胞内的功能性蛋白的表达,但外泌体中多数的miRNA是前体而非功能性miRNA,这些miRNA起着何种生理性意义,学者们正在研究。由于外泌体含有各种蛋白质、RNA和脂质,研究人员正将其进行细胞分类,建立数据库(ExoCarta)。此外,在世界各地分别进行着运用蛋白质组学、转录组学和系统生物学的大规模分析工作,而FunRich的EV plugin作为一种通用的分析手段已被公布出来。今后,在推进外泌体研究方面,各领域的研究人员信息共享至关重要。

 


◆运用外泌体进行治疗和诊断的功能开发


  随着外泌体的功能逐渐被发现,近年来,应用这些功能的治疗法也在被开发出来。例如,血液中的成纤维细胞所释放的外泌体,可以促进角质形成细胞的移动和增殖以及血管新生来促进伤口愈合。有报导指出,外泌体内miRNA参与促进血管新生、抗炎症性和促进胶原蛋白沉淀等一系列过程12)。从癌症患者树突状细胞释放的外泌体中,含有各种癌症细胞来源的蛋白质,可以强化杀伤性T细胞对癌症细胞的特异性反应。利用此功能的抗肿瘤免疫疗法,目前正处于初期临床研究阶段13)。另外,科学家也尝试利用外泌体的抑制发病机制功能。例如,类风湿关节炎患者的滑膜成纤维细胞所释放的外泌体,高浓度集聚诱导细胞死亡的TNF-α,可使类风湿关节炎恶化14)。通过上述介绍可以知道癌症细胞来源的外泌体含有与癌症进展相关的分子,神经细胞来源的外泌体含有与神经退行性疾病相关的分子,因此,通过抑制或去除这些外泌体,有希望抑制疾病发生。随着今后的研究发展,外泌体功能逐步清晰,并扩大临床应用,有望将外泌体应用在各种疾病治疗上。甚至可尝试利用外泌体将siRNA和抗癌药剂等运输到目标细胞中。各种细胞粘着分子在外泌体膜表面表达,由其决定外泌体被运输往哪一种细胞,期望开发利用该特征的新型DDS15)。外泌体在体液中十分稳定,同时外囊泡所含的蛋白质和RNA被外泌体的脂质双层膜所包被也不会分解。另外在从体液中提取外泌体后,体液可长期稳定保存,因此外泌体有望成为临床检测的新型疾病生物标记。外泌体与各种疾病的相关性被检测出,特别是血液中释放的癌细胞来源的外泌体,其与正常细胞来源外泌体在结构分子上的差异倍受瞩目,并作为癌症早期诊断技术,应用于与癌症进展相关的研究16)。甚至人们期望将尿液中的外泌体作为肾脏、前列腺疾病、膀胱疾病的新型诊断标记,髓液中的外泌体作为脑内肿瘤和神经退行性疾病的新型标记物。

 


◆外泌体研究的课题和展望


  已经有许多关于外泌体作用的报导,根据这些现象实验中,从体液和培养上清中高纯度提取的高纯度外泌体,在活体内是否真的能发生作用尚未能确定。确认外泌体生理作用的唯一方法就是明确外泌体的释放机制,通过促进或抑制释放机制,分析会引起何种生理作用,这是进一步研究的发展方向。甚至活体内的外泌体动态(哪个外泌体迁移至何处)也会成为今后需要努力研究的重要课题。

  目前,提取外泌体的方法主要有超速离心法、PEG沉淀法,但这些方法混有非常多的杂质,必须慎重分析得到的是否是外泌体。超速离心法存在操作繁杂、回收量不稳定,不能用于定量分析、必须使用昂贵的超速离心机、无法进行多样品分析等问题。因此外泌体研究相对困难,需要尽快开发操作简单、可提取高纯度外泌体的技术。因此,日本和光着眼于巨噬细胞的外泌体受体Tim4蛋白,制备Tim4细胞外域与磁珠结合的“Tim4磁珠”17)。Tim4通过磷酯酰丝氨酸(PS)法特异性结合Tim4蛋白和磁珠,再经过含有EDTA的洗脱缓冲液进行分离,提取高纯度的完整外泌体。实际上,用PS亲和法提取的人白血病细胞释放的外泌体,其纯度与超离心法和PEG沉淀法提取外泌体做比较, PS亲和法提取的外泌体,其蛋白特异性检测可高出10~100倍以上,几乎没有混入外泌体以外的蛋白,回收量高,操作重复性好。结果表明,PS亲和法可以检测到许多目前为止都无法检测的外泌体蛋白质和RNA。应用Tim4的外泌体强结合能力,可用ELISA或FACS高灵敏度定性检测、定量分析外泌体。以前无法用超速离心法提取的微囊泡,也通过运用PS亲和法实现高纯度提取。本指导书中对该技术进行详细说明,这项技术的有用性今后将受到世界各方评价,有望在外泌体和微囊泡生理功能的分析研究上起重大贡献。

  外泌体的检测和提取还遇到一个困难即:对各种外泌体的分类。研究人员尚未统一定义以何种方法提取的细胞外囊泡可以称之为外泌体,给实验数据的分析和重复性确认带来困难。近年,随着国际细胞外囊泡协会的成立、世界性研究者研讨会的举办,提案MISEV指南作为国际标准,计划或已经开始进行EV研究的科学家请务必阅读这些方针18、19)。另外,建立记录各论文实验条件的数据库也可作为规避混乱的方法之一20)。一方面,随着EV研究倍受世界瞩目,各国启动了大型研究项目。美国启动NIH战略性大型项目(Extracellular RNA Communication),国际权威性学会——Gordon和Keystone Symposia也从2016开始成立会议小组。受到欧洲药物研究开发公司“创新药物倡议组织(IMI)”的支持推进的CANCER-ID项目,也包含EV研究在内。2017年日本选定了EV研究为文部科学省研究开发战略的目标之一,期待会加速今后的研究发展。无论如何,今后EV研究的根本就是必须有强有力的研究方法和技术,而PS亲和法有望成为其中之一。


◆参考文献


[1]

Kowal J, et al. (2016) Proteomic comparison defines novel markers to characterize heterogeneous populations of extracellular vesicle subtypes. Proc Natl Acad Sci U S A, 113 (8) : E968-977.

[2]

Colombo M, Raposo G, & Thery C (2014) Biogenesis, secretion, and intercellular interactions of exosomes and other extracellular vesicles. Annu Rev Cell Dev Biol, 30 : 255-289.

[3]

Bobrie A, Colombo M, Raposo G, & Thery C (2011) Exosome secretion : molecular mechanisms and roles in immune responses. Traffic, 12 (12) : 1659-1668.

[4]

Bahrini I, Song JH, Diez D, & Hanayama R (2015) Neuronal exosomes facilitate synaptic pruning by up-regulating complement factors in microglia. Sci Rep, 5 : 7989.

[5]

Kramer-Albers EM & Hill AF (2016) Extracellular vesicles: interneural shuttles of complex messages. Curr Opin Neurobiol, 39 : 101-107.

[6]

Tkach M & Thery C (2016) Communication by Extracellular Vesicles : Where We Are and Where We Need to Go. Cell, 164 (6) : 1226-1232.

[7]

Hoshino A, et al. (2015) Tumour exosome integrins determine organotropic metastasis. Nature, 527 (7578): 329-335.

[8]

Thomou T, et al. (2017) Adipose-derived circulating miRNAs regulate gene expression in other tissues. Nature, 542 (7642) : 450-455.

[9]

Izquierdo-Useros N, Puertas MC, Borras FE, Blanco J, & Martinez-Picado J (2011)Exosomes and retroviruses : the chicken or the egg? Cell Microbiol, 13 (1) : 10-17.

[10]

Regev-Rudzki N, et al. (2013) Cell-cell communication between malaria-infected red blood cells via exosome-like vesicles. Cell, 153 (5) : 1120-1133.

[11]

Valadi H, et al. (2007) Exosome-mediated transfer of mRNAs and microRNAs is a novel mechanism of genetic exchange between cells. Nat Cell Biol, 9 (6) : 654-659.

[12]

Geiger A, Walker A, & Nissen E (2015) Human fibrocyte-derived exosomes accelerate wound healing in genetically diabetic mice. Biochem Biophys Res Commun, 467 (2) : 303-309.

[13]

Bell BM, Kirk ID, Hiltbrunner S, Gabrielsson S, & Bultema JJ (2016) Designer exosomes as next-generation cancer immunotherapy. Nanomedicine, 12 (1) : 163-169.

[14]

Zhang HG, et al. (2006) A membrane form of TNF-alpha presented by exosomes delays T cell activation-induced cell death. J Immunol, 176 (12) : 7385-7393.

[15] 

Batrakova EV & Kim MS (2015) Using exosomes, naturally-equipped nanocarriers, for drug delivery. J Control Release, 219 : 396-405.

[16]

Thind A & Wilson C (2016) Exosomal miRNAs as cancer biomarkers and therapeutic targets. J Extracell Vesicles, 5 : 31292.

[17]

Nakai W, et al. (2016) A novel affinity-based method for the isolation of highly purified extracellular vesicles. Sci Rep, 6 : 33935.

[18]

Witwer KW, et al. (2013) Standardization of sample collection, isolation and analysis methods in extracellular vesicle research. J Extracell Vesicles, 2.

[19]

Lotvall J, et al. (2014) Minimal experimental requirements for definition of extracellular vesicles and their functions : a position statement from the International Society for Extracellular Vesicles. J Extracell Vesicles, 3 : 26913.

[20]

Consortium E-T, et al. (2017) EV-TRACK : transparent reporting and centralizing knowledge in extracellular vesicle research. Nat Methods, 14 (3) : 228-232.

PS亲和法外泌体提取试剂盒

  MagCapture Exosome Isolation Kit PS提取高纯度完整状态的外泌体。

  外泌体是各种细胞外泌的直径在30-100nm之间的膜囊泡。因外泌体内含mRNA、microRNA等核酸和蛋白质对相邻细胞具有交换信息的功能。作为细胞间信号传导的通讯工具和作为癌等各种疾病的生物标记话题比较热门1、2)。近些年关于外泌体研究很广泛,但是关于外泌体相关的实验技术,关于需要改进的课题存在很多。

  例如,外泌体提纯方法中,超速离心法和聚合物沉淀法(市售试剂盒)混入多种杂质,给后续实验产生了许多障碍。抗体亲和法和密度梯度离心法,虽然可以提取到高纯度的外泌体,但不能提取完整外泌体,无法分析外泌体具有的生理功能,也是两种提取方法的问题所在。而免疫印迹法(WB)和Elisa检测法作为被广泛应用的外泌体检测的一般方法,又存在检测时需使用大量外泌体和难以检测到低表达水平的标记蛋白。

  为了解决外泌体实验遇到的上述的各种问题, Wako 研发出MagCapture™外泌体提取试剂盒PS(MagCapture™  Exosome Isolation Kit PS)提取高纯度细胞外囊泡。

  外泌体膜含有分泌细胞源的蛋白和脂质,众所周知磷脂酰丝氨酸(PS)在活细胞通过翻转酶作用导向细胞膜内侧,暴露在外泌体膜外侧3)。另外,T-cell immunoglobulin domain and mucin domain-containing protein 4(Tim4 通过巨噬细胞进行细胞凋亡的吞噬受体)蛋白通过细胞外域IgV域与含有钙离子的PS结合4)


什么是外泌体

  基于上述知识,我们利用Tim4固化磁珠,在钙离子存在下捕捉培养上清和血清等样品中的外泌体,再添加螯合剂洗脱外泌体,这种外泌体纯化方法是和金泽大学医学系免疫学华山教授共同开发,并取得了成功。5)这是迄今为止取代黄金标准超速离心法的新型外泌体纯化方法。


◆参考文献

[1]

Tkach, M. et al. Communication by Extracellular Vesicles : Where We Are and Where We Need to Go. Cell 164, 1226-1232 (2016).

[2]

Raimondo, F. et al. Advances in membranous vesicle and exosome proteomics improving biological understanding and biomarker discovery. Proteomics 11, 709-720 (2011).

[3]

Trajkovic, K. et al. Ceramide triggers budding of exosome vesicles into multivesicular endosomes. Science 319 (5867) : 1244–7 (2008).

[4]

Miyanishi, M. et al. Identification of Tim4 as a phosphatidylserine receptor. Nature 450, 435-439 (2007).

[5]

Nakai, W. et al. A novel affinity-based method for the isolation of highly purified extracellular vesicles. Sci. Rep. 6, 33935 (2016).

MagCapture™ 外泌体提取试剂盒 PS


什么是外泌体  MagCapture™ Exosome Isolation Kit PS采用磷脂酰丝氨酸(PS)亲和Tim4蛋白的PS亲和法,可方便获得高纯度的外泌体和其他来自细胞培养基和体液的EVs。提取的完整外泌体和其他EVs可用于不同实验:电镜分析,纳米粒子追踪分析,EVs的操作和分析等。

【特点】

● 可提取高纯度的完整外泌体

● 可从血清、血浆、尿液等样品中提取外泌体

● 重复性高,回收量稳定

● 操作简单,可处理多个样品(无需超速离心)